近日,由中央廣播電視總臺發(fā)布的2022年度國內(nèi)、國際十大科技新聞名單正式揭曉。其中,西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家代方銀教授團(tuán)隊聯(lián)合華大基因等單位合作完成的家蠶超級泛基因組項(xiàng)目成功入選2022年度國內(nèi)十大科技新聞。

研究團(tuán)隊通過對1078份蠶種質(zhì)資源進(jìn)行了深度短讀長測序,對其中545份代表性資源進(jìn)行了長讀長測序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個蠶的高質(zhì)量基因組,對100個基因組進(jìn)行了基因注釋,鑒定到4,300余萬個SNP、930余萬個Indel、340余萬個結(jié)構(gòu)變異(SV)和7,308個新基因(家族),繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。該圖譜包含了目前全球最全面的家蠶與野桑蠶基因組信息,是全球動植物領(lǐng)域樣本量最大的長讀長泛基因組。此外,研究團(tuán)隊在全球率先構(gòu)建家蠶基因數(shù)據(jù)庫,對于開啟家蠶設(shè)計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等,將有重要深遠(yuǎn)的意義。

華大基因千蠶高精度基因遺傳變異圖譜入選2022國內(nèi)十大科技新聞

由于家蠶可視遺傳性狀豐富,基因組大小合適,對家蠶的基因組研究將對害蟲防治等具有重要應(yīng)用價值。早在2003年,日本率先開啟了家蠶基因組計劃,該計劃曾與曼哈頓原子彈計劃、阿波羅計劃并稱為20世紀(jì)三大科學(xué)計劃的國際人類基因組計劃。

作為我國基因行業(yè)的奠基者,華大基因曾助力完成人類基因組計劃1%測序工作和水稻基因組項(xiàng)目,擁有成熟穩(wěn)定的基因組測序能力和世界領(lǐng)先的組裝拼接技術(shù)。為了讓中國重新掌握桑蠶業(yè)的話語權(quán),華大基因積極加大研發(fā)資源投入,為西南大學(xué)家蠶基因組研究團(tuán)隊提供技術(shù)支持,同時在測序組裝、信息分析等方面提供專業(yè)支持。

時至今日,隨著國內(nèi)外動植物基因組研究的不斷深入,越來越多物種的泛基因組被相繼公布,泛基因組現(xiàn)已在動植物基因組學(xué)研究中被廣泛用于更為全面地評估物種內(nèi)遺傳多樣性。華大基因基于自主研發(fā)的多組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,為研究團(tuán)隊提供“亞細(xì)胞級分辨率”和“厘米級全景視場”的技術(shù),并同時實(shí)現(xiàn)基因與影像的同時分析。憑借在動植物基因組學(xué)的研究經(jīng)驗(yàn)總結(jié),華大基因?yàn)檠芯繄F(tuán)隊提供長讀長+短讀長測序結(jié)合Hi-C技術(shù)研究策略。

未來,華大基因?qū)楦嗫蒲袡C(jī)構(gòu)、企事業(yè)單位等提供多組學(xué)技術(shù)支持與服務(wù),攜手研究新興模式生物,不斷優(yōu)化升級多組學(xué)技術(shù),為基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘提供科學(xué)支撐,助力動植物育種新突破。

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